Свого часу ми (і я особисто) встигли наламати дров із цим сайтом, тому потрібно наводити все в первозданний вигляд, повертати сайт в індекс Яндекса, і взагалі налагоджувати його нормальну роботу. :-)
Ну і пишу інструкцію навіть для себе, щоб не забути надалі, як все це провернути. Тому якихось описів не буде, а лише покроковий алгоритм, як вимкнути режим мультисайту.
1. Робимо повну резервну копію за інструкцією!Без резервної копії ніколи не беріться редагувати конфігураційні файли, інакше потім втомитеся шукати фахівців, які відновлять сайт у робочий стан!
2. Відкриваємо файл wp-config.php у кореневій директорії сайту та видаляємо рядки:
3. Значення цього рядка змінюємо з true на false:
4. Видаляємо файл .htaccess із кореневої директорії сайту.Не переживайте, на останньому кроці цей файл буде створено знову.
5. Заходимо до phpMyAdmin і видаляємо такі таблиці з бази даних:
- wp_blogs
- wp_blog_versions
- wp_registration_log
- wp_signups
- wp_site
- wp_sitemeta
Виділяємо галочками ці таблиці:

Потім унизу у списку дій вибираємо «Видалити»:

І в наступному вікні підтверджуємо виконання цієї операції:

6. Видаляємо таблиці створених сайтів у нашій мережі.Робиться це за аналогією з попереднім пунктом, але тільки виділяти треба таблиці з назвою wp_1_* і так далі, на скріншоті ви все побачите і зрозумієте:

Поясню: кожен новий сайт у мережі створює однакову структуру таблиць, де цифра у назві таблиці – це порядковий номер сайту у мережі. Таким чином, нам потрібно видалити всі таблиці, що починаються на назва wp_X_таблиці.
7. Видаляємо два поля "spam" і "deleted" з таблиці wp_usersДля цього знаходимо у списку таблиць потрібну нам wp_users і натискаємо на неї:
Вибираємо у верхньому меню розділ "Структура":
Виділяємо два поля «spam» та «deleted»:
І видаляємо їх:
Висновок
Тепер після заходу в адмінку сайту режим мультисайту буде вимкнений. Залишиться лише зайти в "Параметри" - "Постійні посилання" і натиснути "Зберегти" для створення нового файлу .htaccess.